Philippe Jordan commence sa carrière comme Kapellmeister au Stadttheater d'Ulm en 1994/95. De 1998 à 2001, il est Assistant de Daniel Barenboïm au Deutsche Staatsoper de Berlin. De 2001 à 2004, il est Directeur musical de l'Opéra de Graz et de l'Orchestre Philharmonique de Graz. Pendant ce temps, il fait ses débuts dans les plus importants Opéras et festivals internationaux comme le Houston Grand Opera, le Festival de Glyndebourne le Festival d'Aix-en-Provence, le Metropolitan Opera, le Royal Opera House Covent Garden, le Teatro alla Scala, le Bayerischen Staatsoper de Munich, le Salzburger Festspiele (Così fan Tutte), le Wiener Staatsoper et le Festspielhaus Baden Baden (Tannhäuser). De 2006 à 2010 Philippe Jordan a été Principal Guest Conductor au Staatsoper Unter den Linden de Berlin.
En concert, Philippe Jordan a dirigé le Berliner Philharmoniker, le Wiener Philharmoniker, la Staatskapelle de Berlin, le Wiener Symphoniker, le RSO de Vienne, l'Orchestre Philharmonique de Radio France, le Philharmonia Orchestra de Londres, l'Accademia Nazionale di Santa Cecilia, l'Orchestre de la Suisse Romande, le Tonhalle de Zurich, l'Orchestre de chambre d'Europe, le Mahler Chamber Orchestra, l'Orchestre Gustave Mahler des Jeunes, le NDR/ Sinfonie Orchester Hamburg, le DSO Berlin et l'orchestre du Mozarteum de Salzburg. En Amérique du Nord, il a dirigé les orchestres de Seattle, St. Louis, Dallas, Detroit, Chicago, Cleveland, Philadelphia, Washington, Minnesota, Montreal, New York et San Fransisco.
