Stéphane Roy est aussi musicologue, il est l'auteur de plusieurs articles et d'un ouvrage sur l'analyse de la musique électroacoustique (L'Harmattan, Paris, 2003) qui lui a valu en 2005 le Prix Opus du Livre de l'année. En 2021, c'est son dernier disque, L'inaudible, qui a obtenu le Prix Opus 2019-2020 dans la catégorie Album de l'année - Musique actuelle, électroacoustique. Stéphane Roy a par ailleurs remporté des prix et des mentions lors de concours de composition électroacoustique nationaux et internationaux. Ses œuvres ont été présentées à plusieurs reprises tant en Europe que dans les Amériques.
Titulaire d'un doctorat en composition électroacoustique et d'un Ph.D. en musicologie de l'Université de Montréal, il a enseigné à l'Université de Montréal, à l'Université Queen's (Ontario) et dans des conservatoires de musique, tant au Québec qu'à l'étranger. Il prononce de temps à autre des conférences sur son œuvre.
Stéphane Roy est compositeur agréé au Centre de musique canadienne (CMC), et ses œuvres ont été éditées sous diverses étiquettes, notamment empreintes DIGITALes (Kaleidos, 1996; Migrations, 2003; L'inaudible, 2019). Il est présentement membre du conseil d'administration du Groupe Le Vivier.
