Attaché à ses racines, l'Ensemble vit cependant avec son temps et fut placé en 2013 sous la direction de Matthieu Peyrègne, chanteur et chef d'orchestre spécialiste de musique ancienne. Cette formation souhaite honorer la mémoire du Prince Antoine 1er de Monaco, qui régnait au début du XVIIIème siècle. Il partageait sa passion pour la musique baroque avec son ami le roi Louis XIV avec lequel il échangeait régulièrement. Monaco était un passage obligé pour les artistes et les compositeurs qui transitaient entre la France et l'Italie. Fidèle à cette histoire, l'Ensemble Baroque de Monaco se spécialise dans la musique baroque française et italienne. En témoignent ses récentes prestations de la Messe de l'Homme Armé pour 4 chœurs de Carissimi dont la recréation mondiale donna lieu à une tournée de concerts en 2015, ou ses prestations des plus belles pages de la tragédie lyrique telles les Indes Galantes de Rameau ou Armide de Lully. Ou encore la récente recréation mondiale de l'Assunzione della Beata Vergine d'Alessandro Scarlatti, retrouvée et ré éditée par Matthieu Peyrègne.
En tant que chef, Matthieu Peyrègne s'attaque à tous les répertoires, en partant de la musique baroque dont il a fait l'une de ses spécialités, jusqu'à la musique contemporaine qu'il a travaillé aux côtés de Nicole Corti au Chœur Britten de Lyon.
